Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms