Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms