Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAF2Q96CS3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAF2Q96CS3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms