Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCC1Q96CN9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms