Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA10Q969M2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms