Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRUQ92729 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms