Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BRK1Q8WUW1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms