Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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TMIEQ8NEW7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMIEQ8NEW7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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