Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC17Q8N6Y2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms