Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG2Q8N3U4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms