Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZA3

H1FOO, Histone H1oo, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1FOOQ8IZA3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H1FOOQ8IZA3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms