Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC84Q86UT8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms