Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PKD1L3Q7Z443 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD1L3Q7Z443 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD1L3Q7Z443 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD1L3Q7Z443 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD1L3Q7Z443 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD1L3Q7Z443 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD1L3Q7Z443 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD1L3Q7Z443 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD1L3Q7Z443 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD1L3Q7Z443 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD1L3Q7Z443 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD1L3Q7Z443 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD1L3Q7Z443 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD1L3Q7Z443 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD1L3Q7Z443 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD1L3Q7Z443 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD1L3Q7Z443 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD1L3Q7Z443 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD1L3Q7Z443 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms