Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PREX2Q70Z35 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms