Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAXIP1Q6ZW49 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAXIP1Q6ZW49 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms