Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms