Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFX8Q6ZV50 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFX8Q6ZV50 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFX8Q6ZV50 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFX8Q6ZV50 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFX8Q6ZV50 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFX8Q6ZV50 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFX8Q6ZV50 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RFX8Q6ZV50 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFX8Q6ZV50 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFX8Q6ZV50 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFX8Q6ZV50 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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