Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms