Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms