Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP17L2Q6R6M4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms