Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms