Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTR9Q6PD62 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTR9Q6PD62 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms