Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TIGD3Q6B0B8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIGD3Q6B0B8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms