Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUPD1Q68J44 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DUPD1Q68J44 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DUPD1Q68J44 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DUPD1Q68J44 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms