Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZKSCAN2Q63HK3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN2Q63HK3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms