Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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