Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms