Protein–RNA interactions for Protein: Q5U651

RASIP1, Ras-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASIP1Q5U651 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RASIP1Q5U651 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms