Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms