Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F0

DCAF12, DDB1- and CUL4-associated factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF12Q5T6F0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF12Q5T6F0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DCAF12Q5T6F0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DCAF12Q5T6F0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DCAF12Q5T6F0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF12Q5T6F0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms