Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP188Q5SRE5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms