Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms