Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms