Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms