Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms