Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC27Q2M243 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms