Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms