Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC142Q17RM4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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