Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms