Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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