Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME3Q16798 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME3Q16798 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ME3Q16798 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME3Q16798 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME3Q16798 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME3Q16798 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME3Q16798 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME3Q16798 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME3Q16798 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME3Q16798 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME3Q16798 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME3Q16798 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME3Q16798 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME3Q16798 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ME3Q16798 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME3Q16798 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME3Q16798 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME3Q16798 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME3Q16798 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME3Q16798 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ME3Q16798 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME3Q16798 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME3Q16798 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME3Q16798 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME3Q16798 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME3Q16798 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ME3Q16798 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME3Q16798 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME3Q16798 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME3Q16798 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME3Q16798 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME3Q16798 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME3Q16798 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME3Q16798 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME3Q16798 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME3Q16798 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME3Q16798 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME3Q16798 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME3Q16798 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME3Q16798 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME3Q16798 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ME3Q16798 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ME3Q16798 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME3Q16798 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME3Q16798 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME3Q16798 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME3Q16798 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME3Q16798 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME3Q16798 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME3Q16798 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME3Q16798 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME3Q16798 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ME3Q16798 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ME3Q16798 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME3Q16798 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME3Q16798 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME3Q16798 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME3Q16798 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME3Q16798 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME3Q16798 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME3Q16798 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME3Q16798 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
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