Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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