Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
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SGCAQ16586 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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SGCAQ16586 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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SGCAQ16586 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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SGCAQ16586 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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SGCAQ16586 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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SGCAQ16586 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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SGCAQ16586 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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SGCAQ16586 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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SGCAQ16586 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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SGCAQ16586 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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