Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms