Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZIC1Q15915 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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