Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA6Q15825 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNA6Q15825 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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