Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms