Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
ITSN1Q15811 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
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