Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
GAPVD1Q14C86 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GAPVD1Q14C86 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
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