Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
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